Se comparada a métodos tradicionais, apresenta maior eficácia, pois alcança melhores resultados ou resultados equivalentes em menos tempo. Seu funcionamento também é diferente de todos os outros métodos psicoterápicos, pois seu modo de definir o problema, a possibilidade de tratá-lo e o foco da psicoterapia são singulares.

Na terapia EMDR, as memórias traumáticas relacionadas ao estresse atual são localizadas e reprocessadas com o uso da estimulação bilateralizada visual, auditiva ou tátil. Depois de reprocessado o evento passado, novos eventos no presente não servirão como disparadores para os mesmos sentimentos que foram vividos no passado. De acordo com as suposições básicas da terapia, quando o reprocessamento houver terminado, os sintomas das crenças negativas internas que levam a sentimentos negativos desaparecerão.

Na Terapia EMDR, não oferecemos ferramentas para lidar com o problema, mas em vez disso, removemos o problema. Quando o problema é removido, os sintomas deixam de existir.